1、債權(quán)記錄方式不同
　　記賬式國(guó)債通過(guò)債券托管系統(tǒng)記錄債權(quán)，投資者購(gòu)買(mǎi)記賬式國(guó)債必須開(kāi)設(shè)賬戶；購(gòu)買(mǎi)憑證式國(guó)債則不需開(kāi)設(shè)賬戶，由發(fā)售銀行向投資者出示憑證式國(guó)債收款單作為債權(quán)記錄的證明。 
　　2、票面利率確定機(jī)制不同
　　記賬式國(guó)債的票面利率是由國(guó)債承購(gòu)包銷(xiāo)團(tuán)成員投標(biāo)確定的；憑證式國(guó)債的利率是財(cái)政部和中國(guó)人民銀行，參照同期銀行存款利率及市場(chǎng)供求情況等因素確定的。 
　　3、流通或變現(xiàn)方式不同
　　記賬式國(guó)債可以上市流通；憑證式國(guó)債不可以上市流通，但可以提前兌取。 
　　4、到期前賣(mài)出收益預(yù)知程度不同
　　記賬式國(guó)債二級(jí)市場(chǎng)交易價(jià)格是由市場(chǎng)決定的，買(mǎi)賣(mài)價(jià)格（凈價(jià)）有可能高于或低于發(fā)行面值。當(dāng)賣(mài)出價(jià)格高于買(mǎi)入價(jià)格時(shí)，表明賣(mài)出者不僅獲得了持有期間的國(guó)債利息，同時(shí)還獲得了部分價(jià)差收益，當(dāng)賣(mài)出價(jià)格低于買(mǎi)入價(jià)格時(shí)，表明賣(mài)出者雖然獲得了持有期間的國(guó)債利息，但同時(shí)也付出了部分價(jià)差損失。因此，投資者購(gòu)買(mǎi)記賬式國(guó)債于到期前賣(mài)出，其收益是不能提前預(yù)知的。而憑證式國(guó)債在發(fā)行時(shí)就將持有不同時(shí)間提前兌取的分檔利率做了規(guī)定，投資者提前兌取憑證式國(guó)債，按其實(shí)際持有時(shí)間及相應(yīng)的利率檔次計(jì)付利息。也就是說(shuō)，投資者提前兌取憑證式國(guó)債所能獲得的收益是提前預(yù)知的，不會(huì)隨市場(chǎng)利率的變動(dòng)而變動(dòng)。